अधिकांश एनीमे श्रृंखला में, नायक सबसे अधिक पसंद किया जाने वाला चरित्र है, जो कि आश्चर्य की बात नहीं है, यह देखते हुए कि उन्हें कितना स्क्रीन समय प्रदान किया जाता है। दूसरी ओर, खलनायकों के पास बहुत कम अवसर होते हैं, इसलिए उन्हें उन्हें गिनना चाहिए।
एनीमे खलनायकों को अक्सर पूरी तरह से अनैतिक और स्वाभाविक रूप से दुष्ट के रूप में देखा जाता है, लेकिन हमेशा ऐसा नहीं होता है। ऐसे कई उदाहरण हैं जहां प्रतिपक्षी सही रहा है और, एक तरह से, अपने कार्यों को उचित ठहराया है। इन खलनायकों ने न केवल खूब लोकप्रियता बटोरी, बल्कि प्रशंसकों की प्रशंसा और समर्थन भी हासिल किया। इसे ध्यान में रखते हुए, यहां कुछ एनीमे खलनायक हैं जो वास्तव में सही थे।
मदारा उचिहा

मदारा उचिहा यकीनन सबसे प्रसिद्ध नारुतो खलनायक है। छोटी उम्र से ही उन्हें युद्ध की भयावहता का सामना करना पड़ा, जिसमें उन्होंने अपने पिता और भाइयों सहित अपने परिवार के कई सदस्यों को खो दिया। इसने मदारा को एक कठोर योद्धा में बदल दिया जो नफरत के चक्र को तोड़ना चाहता था और एक ऐसी दुनिया बनाना चाहता था जहां हर कोई शांति से रह सके।
मदारा का इरादा मानवता को एक अपरिहार्य जेनजुत्सु के अंदर फंसाने का था, उसे विश्वास था कि व्यक्ति अनिवार्य रूप से अपने आंतरिक अंधेरे के आगे झुक जाएंगे और परिस्थिति की परवाह किए बिना विनाशकारी विकल्प चुनेंगे। भले ही उन्हें चौथे महान निंजा युद्ध के दौरान अपनी हार का सामना करना पड़ा, बोरुतो में सामने आने वाली कहानी ने प्रदर्शित किया कि उनका निंदक दृष्टिकोण पूरी तरह से गलत नहीं था।
यागामी लाइट

डेथ नोट के नायक-विरोधी और प्राथमिक प्रतिपक्षी के रूप में काम करते हुए, यागामी लाइट एक नियमित, परेशानी मुक्त अस्तित्व की तलाश करने वाले एक साधारण हाई स्कूल छात्र के रूप में कथा शुरू करती है। जैसे ही उसे डेथ नोट का पता चला, वह शांत जीवन गायब हो गया। समय के साथ, यागामी लाइट को एहसास हुआ कि अलौकिक बहीखाता में अपार शक्ति है, यह पहचानते हुए कि इसमें सही पर्यवेक्षण के तहत "दुनिया को बदलने" की क्षमता है।
गहरी नैतिक प्रतिबद्धताओं और मजबूत राजनीतिक आदर्शों से प्रेरित होकर, यागामी लाइट ने डेथ नोट के साथ कुख्यात अपराधियों का सफाया करने का संकल्प लिया। उनके धर्मयुद्ध ने अनगिनत निर्दोष लोगों की जान बचाई, जबकि कानून तोड़ने वालों में भय पैदा किया, जिससे समग्र अपराध दर में उल्लेखनीय गिरावट आई। हालाँकि लाइट के कई कार्य निर्विवाद रूप से चरम थे, उनका व्यापक मिशन दुनिया को मौलिक रूप से बेहतर जगह में बदलने के लिए तैयार था।
एनरिको पक्की

एनरिको पक्की को समकालीन शोनेन में सबसे अच्छे खलनायकों में से एक माना जाता है। हालाँकि वह जोजो श्रृंखला में सबसे लोकप्रिय प्रतिपक्षी नहीं हो सकता है, वह यकीनन एकमात्र ऐसा व्यक्ति है जो वास्तव में अपने स्वयं के ऊपर दूसरों के कल्याण के बारे में सोचता है। पक्की ने डर से मुक्त दुनिया बनाने की आकांक्षा की, उनका मानना था कि हर किसी के भाग्य को प्रकट करके, लोगों को चिंता से मुक्त किया जा सकता है।
पक्की ने तर्क दिया कि अगर लोगों को पता हो कि आगे क्या होने वाला है, तो वे डर में नहीं रहेंगे और समाज में सुधार होगा। उनका मानना था कि इस तरह के लाभ के लिए स्वतंत्र इच्छा को हटाना एक मामूली कीमत थी।
बड़ी माँ

वन पीस में बिग मॉम पूरे केक आइलैंड और वानो कंट्री आर्क्स की मुख्य प्रतिद्वंद्वी है। उसके पास आत्माओं को अपनी पसंद के अनुसार हेरफेर करने की असाधारण शक्ति है। इसके अलावा, बिग मॉम की शारीरिक क्षमताएं कहानी के अधिकांश पात्रों से कहीं बेहतर थीं। इतनी ताकतवर होने के बावजूद, बिग मॉम सिर्फ एक जानवर नहीं थी।
वह टोटो लैंड की बुद्धिमान रानी थी। उनका लक्ष्य एक सुरक्षित स्थान बनाना था जहां सभी प्रकार की जातियों के लोग बिना किसी समस्या के रह सकें। प्रारंभ में, यह कोई बड़ा लक्ष्य नहीं लग सकता है, लेकिन यह देखते हुए कि कैसे विश्व सरकार ने सक्रिय रूप से संपूर्ण नस्लों को नष्ट करने की कोशिश की है, यह बहुत समझ में आता है कि उनके लिए एक सुरक्षित आश्रय क्यों होना चाहिए। टोटो लैंड में रहने वाले किसी भी व्यक्ति को वहां रहने के लिए अपनी आत्मा का एक छोटा सा टुकड़ा देना पड़ता था। सच कहूँ तो, शेष विश्व की स्थिति को देखते हुए, यह कोई बड़ी कीमत नहीं थी।
नागातो उज़ुमाकी

नागाटो उज़ुमाकी अब तक के सबसे गहन और अविश्वसनीय खलनायकों में से एक है, जिसे पेन के नाम से जाना जाता है। वह उन कुछ खलनायकों में से एक है जो वास्तव में विश्व शांति के अलावा और कुछ नहीं चाहते थे। नागाटो ने अपने माता-पिता को तब खो दिया जब वह अभी भी बच्चा था। इस घटना ने उसे अंदर तक झकझोर दिया, लेकिन इससे वह एक दुष्ट व्यक्ति नहीं बन सका। इसके बजाय, इसने नागाटो को विश्व शांति की तलाश के लिए प्रेरित किया। थोड़े समय के लिए, उनका मानना था कि यह संभव होगा, खासकर जब उनके दोस्त याहिको और कॉनन उनका समर्थन करने के लिए वहां मौजूद थे।
हालाँकि, कुछ ही समय बाद चीजें ख़राब हो गईं। आख़िरकार, नागाटो को एहसास हुआ कि बल प्रयोग के बिना लक्ष्य हासिल करना संभव नहीं होगा। उनका दृढ़ विश्वास था कि जिन लोगों ने खुद का दर्द नहीं देखा और महसूस नहीं किया, वे दूसरों के दर्द को कभी नहीं समझ पाएंगे। इसलिए उसने पूंछ वाले जानवरों को इकट्ठा करना और संसाधन इकट्ठा करना शुरू कर दिया जिससे वह अपना लक्ष्य पूरा कर सके। वास्तव में, नागाटो के विचार नारुतो की तुलना में कहीं अधिक यथार्थवादी और जमीनी थे। बोरुतो की घटनाएँ नागाटो के सही होने का और प्रमाण हैं।
निशान

फुलमेटल अल्केमिस्ट का स्कार निस्संदेह एनीमे इतिहास के सबसे महान लिखित पात्रों में से एक है। जिस किसी को भी वह प्रिय मानता था, उसे राज्य के रसायनज्ञों ने नष्ट कर दिया था, यही कारण है कि वह उनके प्रति द्वेष रखता था। नरसंहार के बाद, स्कार का एकमात्र उद्देश्य त्रासदी के लिए जिम्मेदार लोगों को मारना बन गया।
स्कार नफरत से अंधा हो गया था, इसलिए उसने कुछ बहुत बुरे निर्णय लिए; हालाँकि, उसने जल्दी से अपने तरीके सुधार लिए, जिसके बाद उसने फादर और होमुनकुली से लड़ना शुरू कर दिया। हालाँकि स्कार की हरकतें हमेशा उचित नहीं थीं, लेकिन कारण निश्चित रूप से उचित था।